BLASTN 2.2.17 Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= bphyst027k09 (1496 letters) Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS, GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences) 5,422,427 sequences; 20,945,727,253 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gb|AC137147.9| Mus musculus chromosome 5, clone RP24-141O20, com... 1503 0.0 dbj|AK163715.1| Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RI... 1501 0.0 emb|Z37515.1|BINHYGDNA Binary vector BinHygTOp aph4, tetA, tetR,... 1501 0.0 dbj|AK227134.1| Arabidopsis thaliana mRNA for pathogenesis-relat... 1499 0.0 dbj|AK230287.1| Arabidopsis thaliana mRNA for RNA binding protei... 1499 0.0 >gb|AC137147.9| Mus musculus chromosome 5, clone RP24-141O20, complete sequence Length = 146343 Score = 1503 bits (758), Expect = 0.0 Identities = 770/774 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 3 ctgggtgatgctgccaacttactgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt 62 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51615 ctgggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt 51556 Query: 63 ggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacgg 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51555 ggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacgg 51496 Query: 123 caaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaact 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51495 caaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaact 51436 Query: 183 gcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccataaaatcattgatatggccat 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 51435 gcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccat 51376 Query: 243 gaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttt 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51375 gaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttt 51316 Query: 303 acgtcacttaaaaaactcatgccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgac 362 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51315 acgtcacttaaaaaactcaggccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgac 51256 Query: 363 gtcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccag 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51255 gtcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccag 51196 Query: 423 cgctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcagt 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 51195 cgctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcggt 51136 Query: 483 gaacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51135 gaacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtg 51076 Query: 543 atatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgta 602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51075 atatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgta 51016 Query: 603 atcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctg 662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 51015 atcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctg 50956 Query: 663 gcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtc 722 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 50955 gcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtc 50896 Query: 723 atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaa 776 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 50895 atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaa 50842 >dbj|AK163715.1| Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930046G19 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence Length = 3923 Score = 1501 bits (757), Expect = 0.0 Identities = 769/773 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 6 ggtgatgctgccaacttactgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc 65 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2184 ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc 2125 Query: 66 ttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2124 ttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa 2065 Query: 126 aagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgca 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2064 aagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgca 2005 Query: 186 gttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccataaaatcattgatatggccatgaa 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2004 gttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaa 1945 Query: 246 tggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgattttacg 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1944 tggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgattttacg 1885 Query: 306 tcacttaaaaaactcatgccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacgtc 365 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1884 tcacttaaaaaactcaggccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacgtc 1825 Query: 366 atcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagcgc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1824 atcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagcgc 1765 Query: 426 tggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcagtgaa 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1764 tggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcggtgaa 1705 Query: 486 cgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgata 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1704 cgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgata 1645 Query: 546 tggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatc 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1644 tggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatc 1585 Query: 606 agcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggca 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1584 agcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggca 1525 Query: 666 cggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatc 725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1524 cggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatc 1465 Query: 726 gggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaaaa 778 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1464 gggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaaaa 1412 >emb|Z37515.1|BINHYGDNA Binary vector BinHygTOp aph4, tetA, tetR, traJ, insB, insA, aphA-3 and trfA genes Length = 12095 Score = 1501 bits (757), Expect = 0.0 Identities = 769/773 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 4 tgggtgatgctgccaacttactgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 63 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 8159 tgggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 8100 Query: 64 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 8099 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 8040 Query: 124 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 8039 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 7980 Query: 184 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccataaaatcattgatatggccatg 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 7979 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatg 7920 Query: 244 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7919 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 7860 Query: 304 cgtcacttaaaaaactcatgccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 363 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7859 cgtcacttaaaaaactcaggccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 7800 Query: 364 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7799 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 7740 Query: 424 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcagtg 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 7739 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcggtg 7680 Query: 484 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7679 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 7620 Query: 544 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7619 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 7560 Query: 604 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7559 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 7500 Query: 664 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7499 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 7440 Query: 724 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaa 776 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 7439 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaa 7387 >dbj|AK227134.1| Arabidopsis thaliana mRNA for pathogenesis-related protein - like, complete cds, clone: RAFL09-82-C06 Length = 1653 Score = 1499 bits (756), Expect = 0.0 Identities = 768/772 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 4 tgggtgatgctgccaacttactgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 63 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1543 tgggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 1484 Query: 64 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1483 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 1424 Query: 124 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1423 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 1364 Query: 184 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccataaaatcattgatatggccatg 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatg 1304 Query: 244 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 1244 Query: 304 cgtcacttaaaaaactcatgccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 363 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 cgtcacttaaaaaactcaggccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 1184 Query: 364 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 1124 Query: 424 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcagtg 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1123 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcggtg 1064 Query: 484 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 1004 Query: 544 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 944 Query: 604 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 884 Query: 664 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 824 Query: 724 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccca 775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 823 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccca 772 >dbj|AK230287.1| Arabidopsis thaliana mRNA for RNA binding protein - like, complete cds, clone: RAFL24-07-A13 Length = 1757 Score = 1499 bits (756), Expect = 0.0 Identities = 768/772 (99%) Strand = Plus / Plus Query: 4 tgggtgatgctgccaacttactgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 63 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 638 tgggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg 697 Query: 64 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 698 gcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc 757 Query: 124 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 758 aaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg 817 Query: 184 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccataaaatcattgatatggccatg 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 818 cagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatg 877 Query: 244 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 aatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgatttta 937 Query: 304 cgtcacttaaaaaactcatgccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 363 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgtcacttaaaaaactcaggccgcagtcggtaacctcgcgcatacagccgggcagtgacg 997 Query: 364 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tcatcgtctgcgcggaaatggacgaacagtggggctatgtcggggctaaatcgcgccagc 1057 Query: 424 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcagtg 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1058 gctggctgttttacgcgtatgacagtctccggaagacggttgttgcgcacgtattcggtg 1117 Query: 484 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 aacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtga 1177 Query: 544 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaa 1237 Query: 604 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctgg 1297 Query: 664 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtca 1357 Query: 724 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccca 775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccca 1409